Actualmente se conoce que el estudio de la dinámica microbiana ofrece un panorama general de la digestión anaerobia, que permite conocer el comportamiento de los microorganismos frente a cambios operativos que puedan presentarse. Estos estudios se han realizado para reactores de lodo granular, sin embargo, los reactores de biopelícula ofrecen una mejor eficiencia en el proceso de producción de biogás, ya que poseen una mayor área de contacto entre el sustrato y la biomasa, que les permite tratar efluentes con altas cargas orgánicas. En este contexto, la presente investigación tiene como objetivo analizar la dinámica de poblaciones microbianas sometidas a cambios operativos en reactores de biopelícula, para la producción de biogás durante la digestión anaerobia de la fracción líquida de residuos sólidos orgánicos. Se utilizó un reactor de biopelícula llamado Reactor Anaerobio Híbrido (RAH), con 1.5 L de Extendosphere™ colonizado como inóculo, con volumen útil del RAH de 2.5 L, operado a temperatura de 35±2°C y pH de 6.8-7.2. El RAH operó en 4 Etapas cada una con una Cva diferente, E1=5-8 gDQO/L•d, E2=7-8 gDQO/L•d, E3= 15-16 gDQO/L•d y E4= 20-21 gDQO/L•d. Se monitoreo el proceso en el influente y efluente del RAH por medio de pH, DQOT, DQOS SST, SSV, Alcalinidad y AGV’s. La caracterización de las comunidades microbianas se realizó tomando muestras de la biopelícula, y por medio de extracción de ADNg y Secuenciación Genética Masiva se determinaron las poblaciones microbianas presentes. La producción de biogás y el rendimiento de metano se analizaron por cromatografía de gases. Finalmente se correlacionaron todas las variables del sistema mediante el Análisis de Componente Principales. Se alcanzaron remociones de DQO y Sólidos mayores al 90%, así como la colonización del soporte supero el 80%. Se obtuvieron aproximadamente 20 L Biogás con un rendimiento de metano alrededor de 0.33 LCH4/gDQOrem.