Los Residuos Sólidos Orgánicos (RSO) pueden ser aprovechados como sustrato mediante la digestión anaerobia en dos etapas en reactores anaerobios de alta eficiencia con el fin de reducir los problemas medio ambientales que estos residuos han generado en los últimos años. En este proyecto se realizó la digestión anaerobia en dos etapas para tratar la fracción líquida de los RSO mediante un reactor anaerobio de lecho fluidizado inverso con arreglo en paralelo a escala piloto y con la implementación de un control automático para regular la expansión del lecho. En la fase 1 y 2 del estudio, el proceso se realizó en modo manual y se enfocó en tratar de encontrar las mejores condiciones de operación remociones de hasta 86 y 81 % en la DQOT y DQOS, respectivamente, en un período de 173 días. En estas fases se trabajó con una CVA de entre 2.12 y 10 gDQO/L∙d con flujos de biogás entre 89 y 110 L/h. Se implementaron mejoras en el pretratamiento del sustrato y en la gestión de la realización de las diferentes actividades para aumentar la eficiencia del sistema anaerobio en dos etapas. También se monitoreó el desarrollo de la biopelícula obteniendo porcentajes de colonización por arriba del 60 %. En la fase 3 se implementó un sistema de control automático utilizando sensores de conductividad eléctrica para poder controlar la expansión del lecho mediante la detección de los cambios en la conductividad eléctrica y la autorregulación de las electroválvulas. Con este sistema implementado, se disminuyó de manera significativa la recuperación del material de soporte a la salida del reactor a 310.6 mL con respecto a los 3313.63 recuperados semanalmente en la fase 1 y 2 mejorando así la formación de la biopelícula y la interacción con el sustrato a degradar al interior de cada columna del reactor.