En los últimos años ha tomado gran importancia el tratamiento de aguas residuales de las industrias; ya que contienen gran cantidad de materia orgánica, recientemente una de las alternativas para eliminar las elevadas concentraciones es por medio de reactores híbridos, debido al diseño permite tener remociones elevadas. Este estudio presenta el tratamiento del efluente de una industria citrícola utilizando un reactor hibrido (FA/RLFI), iniciando con el montaje, arranque, operación y estabilización alimentándolo con sustrato de un reactor de hidrólisis en concentraciones en un rango de 4000 mg/L a 7000 mg/L en los primeros días de arranque se obtuvieron porcentajes de remoción entre 20 y 30% manteniendo las concentraciones se logró estabilizar el Reactor Anaerobio Hibrido (RAH) obteniendo rendimiento 0.30 LCH4/gDQOrem cercanos al teórico. Estabilizado el reactor se realizó el primer aumento de carga de 5 gDQO/L*d a 10 gDQO/L*d donde se obtuvieron porcentajes de remoción entre 80 y 90%, posteriormente se inició la alimentación con el efluente cítrico observando un descenso de la remoción 50 - 70%, pH 4 - 6 y rendimiento de metano 0.25 - 0.05 LCH4/gDQOrem, debido a esto se disminuyó la carga a 8 gDQO/L*d para evitar una desestabilización del reactor, durante este periodo se logró mantener la remoción; sin embargo, el rendimiento de metano se mantenía bajo, una de las causas a esto puede ser por la elevada concentración de SST, SSV y al pH ya que diversos autores atribuyen la inhibición a la digestión anaerobia por la elevada concentración de sólidos y la acumulación de AGV´s, sin embargo, en comparación con otros autores se logró eliminar gran cantidad de DQO con cargas superiores a 4 gDQO/L*d.